Protein–RNA interactions for Protein: P68871

HBB, Hemoglobin subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBBP68871 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HBBP68871 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HBBP68871 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBBP68871 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBBP68871 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBBP68871 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBBP68871 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBBP68871 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBBP68871 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBBP68871 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBBP68871 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBBP68871 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBBP68871 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBBP68871 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBBP68871 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HBBP68871 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBBP68871 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBBP68871 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBBP68871 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBBP68871 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBBP68871 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBBP68871 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HBBP68871 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HBBP68871 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HBBP68871 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HBBP68871 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms