Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTG2P63267 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTG2P63267 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms