Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HERVK_113P63132 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
HERVK_113P63132 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms