Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
UBA52P62987 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
UBA52P62987 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
UBA52P62987 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA52P62987 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA52P62987 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA52P62987 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA52P62987 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA52P62987 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA52P62987 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA52P62987 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA52P62987 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA52P62987 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA52P62987 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA52P62987 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA52P62987 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
UBA52P62987 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBA52P62987 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
UBA52P62987 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
UBA52P62987 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
UBA52P62987 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms