Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ACTA2P62736 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
ACTA2P62736 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms