Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SNRPFP62306 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNRPFP62306 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms