Protein–RNA interactions for Protein: P61601

NCALD, Neurocalcin-delta, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCALDP61601 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
NCALDP61601 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCALDP61601 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCALDP61601 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCALDP61601 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCALDP61601 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCALDP61601 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCALDP61601 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCALDP61601 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCALDP61601 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCALDP61601 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCALDP61601 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCALDP61601 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCALDP61601 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
NCALDP61601 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCALDP61601 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCALDP61601 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCALDP61601 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCALDP61601 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCALDP61601 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCALDP61601 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCALDP61601 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCALDP61601 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
NCALDP61601 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCALDP61601 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCALDP61601 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCALDP61601 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCALDP61601 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
NCALDP61601 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
NCALDP61601 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
NCALDP61601 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NCALDP61601 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCALDP61601 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCALDP61601 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCALDP61601 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCALDP61601 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCALDP61601 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCALDP61601 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCALDP61601 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCALDP61601 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCALDP61601 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NCALDP61601 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCALDP61601 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCALDP61601 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCALDP61601 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCALDP61601 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NCALDP61601 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCALDP61601 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCALDP61601 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCALDP61601 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCALDP61601 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NCALDP61601 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCALDP61601 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCALDP61601 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NCALDP61601 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms