Protein–RNA interactions for Protein: P61081

UBE2M, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2MP61081 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2MP61081 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2MP61081 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms