Protein–RNA interactions for Protein: P59074

CHMP4BP1, Putative charged multivesicular body protein 4B-like protein CHMP4BP1, humanhuman

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BP1P59074 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CHMP4BP1P59074 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CHMP4BP1P59074 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CHMP4BP1P59074 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms