Protein–RNA interactions for Protein: P57739

CLDN2, Claudin-2, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN2P57739 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CLDN2P57739 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN2P57739 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN2P57739 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CLDN2P57739 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN2P57739 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CLDN2P57739 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CLDN2P57739 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN2P57739 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN2P57739 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLDN2P57739 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN2P57739 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CLDN2P57739 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CLDN2P57739 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN2P57739 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CLDN2P57739 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN2P57739 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN2P57739 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN2P57739 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN2P57739 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN2P57739 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN2P57739 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN2P57739 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN2P57739 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN2P57739 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN2P57739 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CLDN2P57739 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN2P57739 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN2P57739 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN2P57739 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN2P57739 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CLDN2P57739 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN2P57739 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN2P57739 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN2P57739 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN2P57739 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CLDN2P57739 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN2P57739 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN2P57739 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN2P57739 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN2P57739 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN2P57739 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN2P57739 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN2P57739 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN2P57739 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN2P57739 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN2P57739 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CLDN2P57739 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN2P57739 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN2P57739 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN2P57739 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN2P57739 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLDN2P57739 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN2P57739 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN2P57739 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN2P57739 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN2P57739 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN2P57739 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CLDN2P57739 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CLDN2P57739 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CLDN2P57739 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms