Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SIK1P57059 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK1P57059 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK1P57059 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK1P57059 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK1P57059 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK1P57059 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK1P57059 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK1P57059 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK1P57059 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK1P57059 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK1P57059 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK1P57059 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK1P57059 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SIK1P57059 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIK1P57059 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIK1P57059 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIK1P57059 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SIK1P57059 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIK1P57059 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SIK1P57059 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK1P57059 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK1P57059 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK1P57059 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK1P57059 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK1P57059 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK1P57059 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK1P57059 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK1P57059 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK1P57059 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK1P57059 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK1P57059 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SIK1P57059 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIK1P57059 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
SIK1P57059 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIK1P57059 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIK1P57059 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIK1P57059 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIK1P57059 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIK1P57059 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIK1P57059 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIK1P57059 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIK1P57059 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIK1P57059 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIK1P57059 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SIK1P57059 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK1P57059 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK1P57059 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK1P57059 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK1P57059 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK1P57059 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK1P57059 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK1P57059 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK1P57059 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK1P57059 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK1P57059 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK1P57059 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK1P57059 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SIK1P57059 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIK1P57059 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIK1P57059 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIK1P57059 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIK1P57059 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIK1P57059 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIK1P57059 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIK1P57059 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SIK1P57059 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
SIK1P57059 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIK1P57059 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIK1P57059 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIK1P57059 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIK1P57059 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIK1P57059 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SIK1P57059 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SIK1P57059 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIK1P57059 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIK1P57059 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIK1P57059 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIK1P57059 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIK1P57059 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIK1P57059 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SIK1P57059 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIK1P57059 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIK1P57059 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIK1P57059 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIK1P57059 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIK1P57059 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SIK1P57059 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIK1P57059 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
SIK1P57059 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIK1P57059 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIK1P57059 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SIK1P57059 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms