Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
H2BFSP57053 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2BFSP57053 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms