Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
MTCP1P56278 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms