Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC13P55735 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC13P55735 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC13P55735 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC13P55735 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC13P55735 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC13P55735 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC13P55735 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC13P55735 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC13P55735 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC13P55735 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC13P55735 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC13P55735 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC13P55735 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SEC13P55735 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC13P55735 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC13P55735 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC13P55735 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC13P55735 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC13P55735 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SEC13P55735 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC13P55735 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC13P55735 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC13P55735 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC13P55735 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC13P55735 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC13P55735 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC13P55735 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC13P55735 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC13P55735 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC13P55735 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC13P55735 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC13P55735 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SEC13P55735 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SEC13P55735 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC13P55735 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC13P55735 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC13P55735 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC13P55735 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC13P55735 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC13P55735 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC13P55735 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC13P55735 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC13P55735 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC13P55735 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC13P55735 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC13P55735 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SEC13P55735 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC13P55735 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC13P55735 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC13P55735 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC13P55735 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC13P55735 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC13P55735 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC13P55735 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC13P55735 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC13P55735 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SEC13P55735 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEC13P55735 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEC13P55735 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEC13P55735 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEC13P55735 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEC13P55735 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SEC13P55735 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC13P55735 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC13P55735 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC13P55735 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC13P55735 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC13P55735 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC13P55735 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC13P55735 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC13P55735 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SEC13P55735 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC13P55735 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC13P55735 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC13P55735 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC13P55735 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC13P55735 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC13P55735 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC13P55735 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC13P55735 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SEC13P55735 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC13P55735 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC13P55735 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC13P55735 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SEC13P55735 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms