Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH8P55286 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH8P55286 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH8P55286 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH8P55286 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH8P55286 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH8P55286 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH8P55286 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CDH8P55286 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CDH8P55286 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CDH8P55286 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CDH8P55286 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH8P55286 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH8P55286 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH8P55286 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH8P55286 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH8P55286 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH8P55286 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH8P55286 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH8P55286 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CDH8P55286 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH8P55286 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CDH8P55286 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CDH8P55286 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH8P55286 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH8P55286 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH8P55286 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH8P55286 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH8P55286 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH8P55286 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH8P55286 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH8P55286 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH8P55286 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CDH8P55286 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH8P55286 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH8P55286 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH8P55286 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH8P55286 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH8P55286 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH8P55286 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH8P55286 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH8P55286 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH8P55286 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CDH8P55286 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.6 ms