Protein–RNA interactions for Protein: P55199

ELL, RNA polymerase II elongation factor ELL, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELLP55199 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ELLP55199 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELLP55199 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELLP55199 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELLP55199 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELLP55199 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELLP55199 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELLP55199 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELLP55199 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELLP55199 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELLP55199 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELLP55199 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELLP55199 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELLP55199 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ELLP55199 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
ELLP55199 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ELLP55199 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
ELLP55199 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
ELLP55199 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ELLP55199 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELLP55199 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELLP55199 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELLP55199 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELLP55199 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELLP55199 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELLP55199 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELLP55199 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ELLP55199 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms