Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHBP55084 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHBP55084 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHBP55084 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHBP55084 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHBP55084 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHBP55084 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHBP55084 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHBP55084 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHBP55084 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHBP55084 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HADHBP55084 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HADHBP55084 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HADHBP55084 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HADHBP55084 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HADHBP55084 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HADHBP55084 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HADHBP55084 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HADHBP55084 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HADHBP55084 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HADHBP55084 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HADHBP55084 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HADHBP55084 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HADHBP55084 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HADHBP55084 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HADHBP55084 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HADHBP55084 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HADHBP55084 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HADHBP55084 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HADHBP55084 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HADHBP55084 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HADHBP55084 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HADHBP55084 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HADHBP55084 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HADHBP55084 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HADHBP55084 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HADHBP55084 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HADHBP55084 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HADHBP55084 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HADHBP55084 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HADHBP55084 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HADHBP55084 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HADHBP55084 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HADHBP55084 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HADHBP55084 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HADHBP55084 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HADHBP55084 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HADHBP55084 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HADHBP55084 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HADHBP55084 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HADHBP55084 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HADHBP55084 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HADHBP55084 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HADHBP55084 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HADHBP55084 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HADHBP55084 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HADHBP55084 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HADHBP55084 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HADHBP55084 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HADHBP55084 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HADHBP55084 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HADHBP55084 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HADHBP55084 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HADHBP55084 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HADHBP55084 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HADHBP55084 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HADHBP55084 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HADHBP55084 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HADHBP55084 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HADHBP55084 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HADHBP55084 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HADHBP55084 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HADHBP55084 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HADHBP55084 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HADHBP55084 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HADHBP55084 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HADHBP55084 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HADHBP55084 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HADHBP55084 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HADHBP55084 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HADHBP55084 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HADHBP55084 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HADHBP55084 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HADHBP55084 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms