Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EPHB3P54753 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
EPHB3P54753 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EPHB3P54753 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms