Protein–RNA interactions for Protein: P54253

ATXN1, Ataxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN1P54253 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATXN1P54253 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATXN1P54253 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATXN1P54253 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms