Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SLC5A3P53794 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SLC5A3P53794 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms