Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ACLYP53396 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ACLYP53396 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACLYP53396 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACLYP53396 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACLYP53396 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACLYP53396 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACLYP53396 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACLYP53396 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACLYP53396 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACLYP53396 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACLYP53396 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACLYP53396 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACLYP53396 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACLYP53396 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACLYP53396 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ACLYP53396 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ACLYP53396 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
ACLYP53396 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACLYP53396 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACLYP53396 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACLYP53396 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACLYP53396 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACLYP53396 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACLYP53396 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACLYP53396 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACLYP53396 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACLYP53396 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACLYP53396 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACLYP53396 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ACLYP53396 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACLYP53396 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ACLYP53396 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACLYP53396 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACLYP53396 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACLYP53396 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACLYP53396 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACLYP53396 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACLYP53396 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ACLYP53396 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACLYP53396 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ACLYP53396 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACLYP53396 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACLYP53396 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACLYP53396 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACLYP53396 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACLYP53396 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACLYP53396 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACLYP53396 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ACLYP53396 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACLYP53396 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ACLYP53396 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACLYP53396 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACLYP53396 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ACLYP53396 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACLYP53396 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACLYP53396 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACLYP53396 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACLYP53396 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACLYP53396 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACLYP53396 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACLYP53396 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ACLYP53396 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ACLYP53396 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms