Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HK3P52790 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HK3P52790 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HK3P52790 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HK3P52790 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HK3P52790 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HK3P52790 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HK3P52790 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
HK3P52790 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HK3P52790 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HK3P52790 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HK3P52790 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HK3P52790 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms