Protein–RNA interactions for Protein: P52294

KPNA1, Importin subunit alpha-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KPNA1P52294 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KPNA1P52294 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KPNA1P52294 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms