Protein–RNA interactions for Protein: P51965

UBE2E1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E1P51965 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
UBE2E1P51965 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
UBE2E1P51965 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms