Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.86■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC38.86■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.85■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC38.84■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC38.83■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.83■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC38.82■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.81
SMARCA2P51531 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC38.82■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC38.82■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.82■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.81■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC38.81■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC38.8■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC38.79■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC38.78■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC38.77■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC38.76■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.76■■■■□ 3.8
SMARCA2P51531 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC38.76■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.75■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC38.75■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.75■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC38.74■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC38.73■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.73■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC38.72■■■■□ 3.79
SMARCA2P51531 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC38.72■■■■□ 3.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms