Protein–RNA interactions for Protein: P49336

CDK8, Cyclin-dependent kinase 8, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK8P49336 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK8P49336 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK8P49336 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK8P49336 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK8P49336 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK8P49336 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK8P49336 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK8P49336 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK8P49336 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK8P49336 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDK8P49336 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK8P49336 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK8P49336 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK8P49336 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK8P49336 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK8P49336 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDK8P49336 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK8P49336 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK8P49336 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK8P49336 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK8P49336 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK8P49336 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK8P49336 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK8P49336 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK8P49336 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK8P49336 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK8P49336 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDK8P49336 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDK8P49336 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK8P49336 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK8P49336 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK8P49336 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK8P49336 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK8P49336 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK8P49336 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDK8P49336 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDK8P49336 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK8P49336 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK8P49336 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK8P49336 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK8P49336 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK8P49336 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDK8P49336 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK8P49336 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK8P49336 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK8P49336 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK8P49336 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK8P49336 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK8P49336 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK8P49336 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK8P49336 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK8P49336 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK8P49336 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK8P49336 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK8P49336 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDK8P49336 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDK8P49336 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDK8P49336 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDK8P49336 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK8P49336 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK8P49336 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK8P49336 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK8P49336 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK8P49336 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK8P49336 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK8P49336 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK8P49336 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK8P49336 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK8P49336 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDK8P49336 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms