Protein–RNA interactions for Protein: P49257

LMAN1, Protein ERGIC-53, humanhuman

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN1P49257 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
LMAN1P49257 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LMAN1P49257 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms