Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME1P48163 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME1P48163 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME1P48163 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME1P48163 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME1P48163 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME1P48163 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ME1P48163 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME1P48163 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME1P48163 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME1P48163 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME1P48163 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME1P48163 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ME1P48163 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ME1P48163 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME1P48163 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME1P48163 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME1P48163 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME1P48163 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME1P48163 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME1P48163 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME1P48163 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME1P48163 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME1P48163 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME1P48163 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME1P48163 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ME1P48163 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME1P48163 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME1P48163 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME1P48163 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME1P48163 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME1P48163 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME1P48163 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ME1P48163 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME1P48163 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME1P48163 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ME1P48163 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME1P48163 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ME1P48163 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ME1P48163 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME1P48163 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME1P48163 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME1P48163 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME1P48163 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ME1P48163 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ME1P48163 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME1P48163 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ME1P48163 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ME1P48163 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ME1P48163 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ME1P48163 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME1P48163 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME1P48163 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME1P48163 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME1P48163 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME1P48163 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME1P48163 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME1P48163 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME1P48163 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ME1P48163 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME1P48163 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME1P48163 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME1P48163 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME1P48163 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ME1P48163 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME1P48163 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME1P48163 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME1P48163 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ME1P48163 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME1P48163 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME1P48163 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME1P48163 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ME1P48163 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME1P48163 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME1P48163 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ME1P48163 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ME1P48163 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME1P48163 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME1P48163 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME1P48163 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME1P48163 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME1P48163 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME1P48163 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ME1P48163 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME1P48163 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ME1P48163 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms