Protein–RNA interactions for Protein: P41002

CCNF, Cyclin-F, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNFP41002 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNFP41002 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNFP41002 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNFP41002 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNFP41002 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNFP41002 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNFP41002 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNFP41002 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCNFP41002 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCNFP41002 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNFP41002 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNFP41002 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNFP41002 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNFP41002 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNFP41002 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNFP41002 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNFP41002 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNFP41002 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCNFP41002 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCNFP41002 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNFP41002 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNFP41002 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNFP41002 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNFP41002 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNFP41002 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNFP41002 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCNFP41002 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNFP41002 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNFP41002 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNFP41002 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNFP41002 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNFP41002 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNFP41002 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNFP41002 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNFP41002 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNFP41002 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNFP41002 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNFP41002 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNFP41002 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCNFP41002 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNFP41002 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNFP41002 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNFP41002 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNFP41002 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNFP41002 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCNFP41002 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCNFP41002 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CCNFP41002 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
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