Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDH1P40925 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDH1P40925 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDH1P40925 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDH1P40925 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDH1P40925 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDH1P40925 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDH1P40925 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDH1P40925 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDH1P40925 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
MDH1P40925 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MDH1P40925 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MDH1P40925 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
MDH1P40925 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
MDH1P40925 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDH1P40925 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDH1P40925 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDH1P40925 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDH1P40925 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDH1P40925 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDH1P40925 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
MDH1P40925 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MDH1P40925 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MDH1P40925 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MDH1P40925 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MDH1P40925 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MDH1P40925 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130 ms