Protein–RNA interactions for Protein: P36543

ATP6V1E1, V-type proton ATPase subunit E 1, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1E1P36543 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP6V1E1P36543 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
ATP6V1E1P36543 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms