Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CTNNB1P35222 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CTNNB1P35222 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms