Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP2P32456 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP2P32456 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP2P32456 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP2P32456 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP2P32456 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP2P32456 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP2P32456 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP2P32456 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP2P32456 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GBP2P32456 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GBP2P32456 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP2P32456 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP2P32456 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP2P32456 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP2P32456 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP2P32456 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP2P32456 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP2P32456 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP2P32456 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP2P32456 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP2P32456 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP2P32456 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP2P32456 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP2P32456 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GBP2P32456 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
GBP2P32456 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP2P32456 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP2P32456 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GBP2P32456 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP2P32456 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP2P32456 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP2P32456 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP2P32456 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP2P32456 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP2P32456 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP2P32456 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP2P32456 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP2P32456 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP2P32456 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP2P32456 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP2P32456 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP2P32456 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GBP2P32456 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GBP2P32456 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GBP2P32456 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms