Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXA11P31270 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
HOXA11P31270 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HOXA11P31270 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms