Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TSPOP30536 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TSPOP30536 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TSPOP30536 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TSPOP30536 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms