Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
EPHB2P29323 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
EPHB2P29323 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms