Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTGFP29279 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTGFP29279 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTGFP29279 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTGFP29279 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CTGFP29279 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTGFP29279 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTGFP29279 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTGFP29279 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTGFP29279 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTGFP29279 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CTGFP29279 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CTGFP29279 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
CTGFP29279 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTGFP29279 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTGFP29279 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTGFP29279 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTGFP29279 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTGFP29279 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
CTGFP29279 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTGFP29279 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTGFP29279 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTGFP29279 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTGFP29279 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTGFP29279 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTGFP29279 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTGFP29279 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CTGFP29279 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CTGFP29279 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTGFP29279 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTGFP29279 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTGFP29279 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTGFP29279 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTGFP29279 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
CTGFP29279 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTGFP29279 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTGFP29279 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTGFP29279 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTGFP29279 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTGFP29279 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CTGFP29279 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTGFP29279 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTGFP29279 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CTGFP29279 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTGFP29279 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTGFP29279 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTGFP29279 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTGFP29279 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CTGFP29279 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTGFP29279 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTGFP29279 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTGFP29279 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTGFP29279 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CTGFP29279 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTGFP29279 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTGFP29279 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CTGFP29279 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTGFP29279 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTGFP29279 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTGFP29279 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTGFP29279 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTGFP29279 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTGFP29279 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTGFP29279 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTGFP29279 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTGFP29279 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTGFP29279 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CTGFP29279 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTGFP29279 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTGFP29279 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTGFP29279 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTGFP29279 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CTGFP29279 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CTGFP29279 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms