Protein–RNA interactions for Protein: P28472

GABRB3, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRB3P28472 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GABRB3P28472 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GABRB3P28472 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GABRB3P28472 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms