Protein–RNA interactions for Protein: P26583

HMGB2, High mobility group protein B2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB2P26583 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HMGB2P26583 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HMGB2P26583 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC27.54■■■□□ 2
HMGB2P26583 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGB2P26583 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HMGB2P26583 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HMGB2P26583 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGB2P26583 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGB2P26583 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGB2P26583 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HMGB2P26583 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HMGB2P26583 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HMGB2P26583 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HMGB2P26583 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HMGB2P26583 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMGB2P26583 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HMGB2P26583 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HMGB2P26583 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HMGB2P26583 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMGB2P26583 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HMGB2P26583 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMGB2P26583 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
HMGB2P26583 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HMGB2P26583 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms