Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LMO1P25800 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO1P25800 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO1P25800 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO1P25800 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO1P25800 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO1P25800 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO1P25800 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO1P25800 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO1P25800 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO1P25800 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO1P25800 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LMO1P25800 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LMO1P25800 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMO1P25800 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMO1P25800 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LMO1P25800 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO1P25800 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO1P25800 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO1P25800 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO1P25800 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO1P25800 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO1P25800 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO1P25800 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO1P25800 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO1P25800 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO1P25800 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO1P25800 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO1P25800 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LMO1P25800 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
LMO1P25800 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LMO1P25800 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms