Protein–RNA interactions for Protein: P23921

RRM1, Ribonucleoside-diphosphate reductase large subunit, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM1P23921 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RRM1P23921 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RRM1P23921 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRM1P23921 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRM1P23921 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRM1P23921 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRM1P23921 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRM1P23921 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RRM1P23921 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRM1P23921 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRM1P23921 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRM1P23921 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RRM1P23921 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RRM1P23921 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRM1P23921 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRM1P23921 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRM1P23921 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRM1P23921 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRM1P23921 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRM1P23921 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RRM1P23921 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRM1P23921 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRM1P23921 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRM1P23921 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RRM1P23921 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RRM1P23921 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RRM1P23921 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RRM1P23921 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRM1P23921 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRM1P23921 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRM1P23921 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RRM1P23921 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRM1P23921 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RRM1P23921 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRM1P23921 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRM1P23921 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRM1P23921 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RRM1P23921 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RRM1P23921 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRM1P23921 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRM1P23921 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRM1P23921 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRM1P23921 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRM1P23921 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRM1P23921 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RRM1P23921 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRM1P23921 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRM1P23921 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRM1P23921 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRM1P23921 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RRM1P23921 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms