Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPREP23469 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPREP23469 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPREP23469 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPREP23469 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPREP23469 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPREP23469 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPREP23469 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPREP23469 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPREP23469 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPREP23469 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPREP23469 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPREP23469 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPREP23469 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPREP23469 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPREP23469 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPREP23469 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPREP23469 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPREP23469 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPREP23469 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPREP23469 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPREP23469 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPREP23469 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPREP23469 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPREP23469 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPREP23469 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPREP23469 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPREP23469 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPREP23469 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPREP23469 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPREP23469 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPREP23469 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPREP23469 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPREP23469 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPREP23469 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPREP23469 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPREP23469 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPREP23469 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PTPREP23469 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPREP23469 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PTPREP23469 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPREP23469 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPREP23469 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPREP23469 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPREP23469 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPREP23469 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPREP23469 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PTPREP23469 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPREP23469 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPREP23469 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPREP23469 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPREP23469 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPREP23469 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPREP23469 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPREP23469 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPREP23469 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPREP23469 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPREP23469 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPREP23469 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PTPREP23469 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PTPREP23469 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPREP23469 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPREP23469 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPREP23469 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPREP23469 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPREP23469 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPREP23469 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPREP23469 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPREP23469 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PTPREP23469 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PTPREP23469 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
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