Protein–RNA interactions for Protein: P21810

BGN, Biglycan, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BGNP21810 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BGNP21810 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BGNP21810 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BGNP21810 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BGNP21810 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BGNP21810 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BGNP21810 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BGNP21810 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BGNP21810 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BGNP21810 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BGNP21810 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BGNP21810 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BGNP21810 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BGNP21810 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BGNP21810 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BGNP21810 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BGNP21810 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
BGNP21810 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BGNP21810 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BGNP21810 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BGNP21810 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BGNP21810 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BGNP21810 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BGNP21810 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BGNP21810 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
BGNP21810 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.29■■□□□ 1
BGNP21810 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
BGNP21810 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
BGNP21810 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BGNP21810 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BGNP21810 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BGNP21810 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
BGNP21810 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BGNP21810 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BGNP21810 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BGNP21810 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BGNP21810 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
BGNP21810 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.28■■□□□ 1
BGNP21810 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BGNP21810 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BGNP21810 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BGNP21810 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BGNP21810 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
BGNP21810 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BGNP21810 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BGNP21810 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
BGNP21810 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BGNP21810 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.27■■□□□ 1
BGNP21810 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
BGNP21810 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BGNP21810 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
BGNP21810 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
BGNP21810 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
BGNP21810 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BGNP21810 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
BGNP21810 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
BGNP21810 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BGNP21810 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BGNP21810 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BGNP21810 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
BGNP21810 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BGNP21810 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BGNP21810 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BGNP21810 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BGNP21810 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
BGNP21810 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
BGNP21810 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
BGNP21810 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BGNP21810 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
BGNP21810 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BGNP21810 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BGNP21810 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BGNP21810 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BGNP21810 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BGNP21810 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BGNP21810 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
BGNP21810 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BGNP21810 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BGNP21810 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BGNP21810 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
BGNP21810 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms