Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CDK11BP21127 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CDK11BP21127 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CDK11BP21127 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms