Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTF3P20783 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTF3P20783 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTF3P20783 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NTF3P20783 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
NTF3P20783 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
NTF3P20783 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
NTF3P20783 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NTF3P20783 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTF3P20783 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTF3P20783 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTF3P20783 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTF3P20783 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTF3P20783 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTF3P20783 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NTF3P20783 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NTF3P20783 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NTF3P20783 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NTF3P20783 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NTF3P20783 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NTF3P20783 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms