Protein–RNA interactions for Protein: P20338

RAB4A, Ras-related protein Rab-4A, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB4AP20338 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RAB4AP20338 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RAB4AP20338 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms