Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG1P18858 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG1P18858 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG1P18858 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG1P18858 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG1P18858 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG1P18858 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG1P18858 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG1P18858 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG1P18858 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LIG1P18858 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG1P18858 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG1P18858 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG1P18858 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG1P18858 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG1P18858 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG1P18858 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG1P18858 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG1P18858 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG1P18858 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG1P18858 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG1P18858 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
LIG1P18858 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LIG1P18858 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG1P18858 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG1P18858 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG1P18858 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG1P18858 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG1P18858 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG1P18858 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG1P18858 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG1P18858 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG1P18858 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG1P18858 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LIG1P18858 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LIG1P18858 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG1P18858 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG1P18858 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG1P18858 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG1P18858 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG1P18858 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG1P18858 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG1P18858 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG1P18858 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG1P18858 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG1P18858 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG1P18858 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LIG1P18858 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIG1P18858 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIG1P18858 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIG1P18858 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIG1P18858 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIG1P18858 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIG1P18858 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LIG1P18858 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG1P18858 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG1P18858 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG1P18858 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG1P18858 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG1P18858 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG1P18858 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG1P18858 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG1P18858 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG1P18858 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG1P18858 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LIG1P18858 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LIG1P18858 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LIG1P18858 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIG1P18858 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIG1P18858 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LIG1P18858 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms