Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HOXB8P17481 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HOXB8P17481 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms