Protein–RNA interactions for Protein: P16499

PDE6A, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 860 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6AP16499 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE6AP16499 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE6AP16499 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms