Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
GP1BBP13224 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
GP1BBP13224 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms